MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245

Total Repeats: 74179

< Previous12...137138139140141142143144145146147148149Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_016617	CGG	2	6	3016334	3016339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383663
74002	NC_016617	GCG	3	9	3016364	3016372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383663
74003	NC_016617	CTG	3	9	3016380	3016388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383663
74004	NC_016617	CGC	2	6	3016431	3016436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74005	NC_016617	CG	3	6	3016440	3016445	0 %	0 %	50 %	50 %	392383663
74006	NC_016617	GC	3	6	3016451	3016456	0 %	0 %	50 %	50 %	392383663
74007	NC_016617	TCG	2	6	3016477	3016482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383663
74008	NC_016617	CGC	2	6	3016496	3016501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74009	NC_016617	CGG	2	6	3016504	3016509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383663
74010	NC_016617	CG	3	6	3016524	3016529	0 %	0 %	50 %	50 %	392383663
74011	NC_016617	CGC	2	6	3016580	3016585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74012	NC_016617	GCC	2	6	3016601	3016606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74013	NC_016617	TCC	2	6	3016662	3016667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383663
74014	NC_016617	GCG	2	6	3016732	3016737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383663
74015	NC_016617	GCT	2	6	3016760	3016765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383663
74016	NC_016617	TCG	2	6	3016774	3016779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383663
74017	NC_016617	GCC	2	6	3016786	3016791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74018	NC_016617	CGC	2	6	3016820	3016825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74019	NC_016617	CGGAA	2	10	3016827	3016836	40 %	0 %	40 %	20 %	392383663
74020	NC_016617	GCT	2	6	3016870	3016875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383663
74021	NC_016617	CGC	2	6	3016894	3016899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383663
74022	NC_016617	CCG	2	6	3017126	3017131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74023	NC_016617	CTG	2	6	3017145	3017150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74024	NC_016617	CGC	2	6	3017174	3017179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74025	NC_016617	CGC	2	6	3017186	3017191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74026	NC_016617	GAG	2	6	3017217	3017222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392383664
74027	NC_016617	GCG	2	6	3017245	3017250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74028	NC_016617	AGGG	2	8	3017281	3017288	25 %	0 %	75 %	0 %	392383664
74029	NC_016617	ACG	2	6	3017341	3017346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74030	NC_016617	CGG	2	6	3017374	3017379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74031	NC_016617	CCG	2	6	3017407	3017412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74032	NC_016617	GCC	2	6	3017478	3017483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74033	NC_016617	ACG	2	6	3017500	3017505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74034	NC_016617	GC	3	6	3017525	3017530	0 %	0 %	50 %	50 %	392383664
74035	NC_016617	CGG	2	6	3017684	3017689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74036	NC_016617	CGG	2	6	3017701	3017706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74037	NC_016617	CGC	2	6	3017735	3017740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74038	NC_016617	CGG	2	6	3017750	3017755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74039	NC_016617	CCG	2	6	3017771	3017776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74040	NC_016617	CAC	2	6	3017777	3017782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383664
74041	NC_016617	ACC	2	6	3017808	3017813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383664
74042	NC_016617	CTG	3	9	3017814	3017822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74043	NC_016617	CGC	2	6	3017855	3017860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74044	NC_016617	CG	3	6	3017895	3017900	0 %	0 %	50 %	50 %	392383664
74045	NC_016617	GCG	2	6	3017935	3017940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74046	NC_016617	CCG	2	6	3017950	3017955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74047	NC_016617	ATGT	2	8	3018021	3018028	25 %	50 %	25 %	0 %	392383664
74048	NC_016617	CGG	2	6	3018070	3018075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74049	NC_016617	TCG	2	6	3018139	3018144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74050	NC_016617	TAT	2	6	3018192	3018197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392383664
74051	NC_016617	ACG	2	6	3018238	3018243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383664
74052	NC_016617	CCG	2	6	3018384	3018389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383664
74053	NC_016617	GCG	2	6	3018446	3018451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383664
74054	NC_016617	GA	3	6	3018460	3018465	50 %	0 %	50 %	0 %	392383664
74055	NC_016617	CCGGA	2	10	3018503	3018512	20 %	0 %	40 %	40 %	392383665
74056	NC_016617	CCAC	2	8	3018517	3018524	25 %	0 %	0 %	75 %	392383665
74057	NC_016617	TGG	2	6	3018567	3018572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383665
74058	NC_016617	CCG	2	6	3018589	3018594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383665
74059	NC_016617	AGC	2	6	3018643	3018648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383665
74060	NC_016617	CCG	2	6	3018679	3018684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383665
74061	NC_016617	CAGC	2	8	3018701	3018708	25 %	0 %	25 %	50 %	392383665
74062	NC_016617	CGC	2	6	3018762	3018767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383666
74063	NC_016617	GA	3	6	3018772	3018777	50 %	0 %	50 %	0 %	392383666
74064	NC_016617	CGA	2	6	3018819	3018824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383666
74065	NC_016617	GAT	2	6	3018889	3018894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383666
74066	NC_016617	CCGC	2	8	3018895	3018902	0 %	0 %	25 %	75 %	392383666
74067	NC_016617	GGT	3	9	3018918	3018926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383666
74068	NC_016617	CGGCG	2	10	3019059	3019068	0 %	0 %	60 %	40 %	392383666
74069	NC_016617	CCT	2	6	3019074	3019079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383666
74070	NC_016617	TCC	2	6	3019094	3019099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383666
74071	NC_016617	GCG	2	6	3019214	3019219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383667
74072	NC_016617	TGC	2	6	3019245	3019250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383667
74073	NC_016617	ATA	2	6	3019261	3019266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392383667
74074	NC_016617	ATTC	2	8	3019272	3019279	25 %	50 %	0 %	25 %	392383667
74075	NC_016617	T	7	7	3019296	3019302	0 %	100 %	0 %	0 %	392383667
74076	NC_016617	GCC	2	6	3019349	3019354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383667
74077	NC_016617	TCCGG	2	10	3019401	3019410	0 %	20 %	40 %	40 %	392383667
74078	NC_016617	TTGC	2	8	3019431	3019438	0 %	50 %	25 %	25 %	392383667
74079	NC_016617	GCC	2	6	3019444	3019449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383667
74080	NC_016617	TG	3	6	3019460	3019465	0 %	50 %	50 %	0 %	392383667
74081	NC_016617	GTCG	2	8	3019466	3019473	0 %	25 %	50 %	25 %	392383667
74082	NC_016617	CTC	2	6	3019495	3019500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383667
74083	NC_016617	GTC	2	6	3019501	3019506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383667
74084	NC_016617	GC	3	6	3019696	3019701	0 %	0 %	50 %	50 %	392383668
74085	NC_016617	TTC	2	6	3019758	3019763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383668
74086	NC_016617	ACCGGC	2	12	3019796	3019807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392383668
74087	NC_016617	CCG	2	6	3019812	3019817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383668
74088	NC_016617	AAG	2	6	3019856	3019861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392383668
74089	NC_016617	CG	3	6	3019905	3019910	0 %	0 %	50 %	50 %	392383668
74090	NC_016617	CGGC	2	8	3019948	3019955	0 %	0 %	50 %	50 %	392383668
74091	NC_016617	CCG	2	6	3019966	3019971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383668
74092	NC_016617	CGG	2	6	3019984	3019989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74093	NC_016617	TGG	2	6	3020040	3020045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383668
74094	NC_016617	GCC	2	6	3020055	3020060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383668
74095	NC_016617	GTGC	2	8	3020086	3020093	0 %	25 %	50 %	25 %	392383668
74096	NC_016617	GGT	2	6	3020170	3020175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383668
74097	NC_016617	AGC	2	6	3020190	3020195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383668
74098	NC_016617	CTG	2	6	3020204	3020209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383668
74099	NC_016617	CCA	2	6	3020217	3020222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383668
74100	NC_016617	CA	3	6	3020247	3020252	50 %	0 %	0 %	50 %	392383668
74101	NC_016617	CCA	2	6	3020295	3020300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383668
74102	NC_016617	CCT	2	6	3020368	3020373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383668
74103	NC_016617	AGG	2	6	3020376	3020381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392383668
74104	NC_016617	GAA	2	6	3020449	3020454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392383668
74105	NC_016617	CGTG	2	8	3020506	3020513	0 %	25 %	50 %	25 %	392383668
74106	NC_016617	GCG	2	6	3020532	3020537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74107	NC_016617	TGG	2	6	3020550	3020555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383668
74108	NC_016617	CGAC	2	8	3020556	3020563	25 %	0 %	25 %	50 %	392383668
74109	NC_016617	GC	3	6	3020570	3020575	0 %	0 %	50 %	50 %	392383668
74110	NC_016617	CATCGA	2	12	3020578	3020589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392383668
74111	NC_016617	CACG	2	8	3020596	3020603	25 %	0 %	25 %	50 %	392383668
74112	NC_016617	TCA	2	6	3020604	3020609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383668
74113	NC_016617	CCGC	2	8	3020661	3020668	0 %	0 %	25 %	75 %	392383668
74114	NC_016617	GAG	2	6	3020708	3020713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392383668
74115	NC_016617	CGG	2	6	3020760	3020765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74116	NC_016617	GGT	2	6	3020791	3020796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383668
74117	NC_016617	GGC	2	6	3020797	3020802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74118	NC_016617	GCC	2	6	3020824	3020829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383668
74119	NC_016617	AGC	2	6	3020844	3020849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383668
74120	NC_016617	GCA	3	9	3020872	3020880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383668
74121	NC_016617	GCG	2	6	3020886	3020891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74122	NC_016617	CAG	2	6	3021017	3021022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383668
74123	NC_016617	CCG	2	6	3021034	3021039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383668
74124	NC_016617	CCCCG	2	10	3021040	3021049	0 %	0 %	20 %	80 %	392383668
74125	NC_016617	GGC	2	6	3021053	3021058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383668
74126	NC_016617	CGGG	2	8	3021063	3021070	0 %	0 %	75 %	25 %	392383668
74127	NC_016617	CCG	2	6	3021136	3021141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383669
74128	NC_016617	TCG	2	6	3021169	3021174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383669
74129	NC_016617	GCGCC	2	10	3021194	3021203	0 %	0 %	40 %	60 %	392383669
74130	NC_016617	CTGGAC	2	12	3021219	3021230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392383669
74131	NC_016617	CCG	2	6	3021235	3021240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383669
74132	NC_016617	CGC	2	6	3021274	3021279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383669
74133	NC_016617	GCG	2	6	3021295	3021300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383669
74134	NC_016617	CGG	2	6	3021377	3021382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383669
74135	NC_016617	CGA	2	6	3021383	3021388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383669
74136	NC_016617	GC	3	6	3021435	3021440	0 %	0 %	50 %	50 %	392383669
74137	NC_016617	CCG	2	6	3021446	3021451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383669
74138	NC_016617	CTG	2	6	3021486	3021491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383669
74139	NC_016617	CCGACC	2	12	3021508	3021519	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	392383669
74140	NC_016617	CAT	2	6	3021525	3021530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383669
74141	NC_016617	CGC	2	6	3021549	3021554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383669
74142	NC_016617	GCT	2	6	3021630	3021635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383669
74143	NC_016617	AGC	2	6	3021905	3021910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74144	NC_016617	GTC	2	6	3021911	3021916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74145	NC_016617	GTT	2	6	3021961	3021966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392383670
74146	NC_016617	GAT	2	6	3021988	3021993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383670
74147	NC_016617	CAT	2	6	3021999	3022004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383670
74148	NC_016617	CGGA	2	8	3022063	3022070	25 %	0 %	50 %	25 %	392383670
74149	NC_016617	ACG	2	6	3022109	3022114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74150	NC_016617	CCG	2	6	3022124	3022129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383670
74151	NC_016617	TGA	2	6	3022167	3022172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383670
74152	NC_016617	CGC	2	6	3022179	3022184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383670
74153	NC_016617	ATA	2	6	3022198	3022203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392383670
74154	NC_016617	CGT	2	6	3022206	3022211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74155	NC_016617	GCCC	2	8	3022213	3022220	0 %	0 %	25 %	75 %	392383670
74156	NC_016617	GTC	2	6	3022234	3022239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74157	NC_016617	CAG	2	6	3022252	3022257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74158	NC_016617	GCC	2	6	3022300	3022305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383670
74159	NC_016617	CGT	2	6	3022323	3022328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74160	NC_016617	AGA	2	6	3022364	3022369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392383670
74161	NC_016617	GCT	2	6	3022405	3022410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383670
74162	NC_016617	CGC	2	6	3022438	3022443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383670
74163	NC_016617	TGA	2	6	3022518	3022523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383670
74164	NC_016617	GAAT	2	8	3022561	3022568	50 %	25 %	25 %	0 %	392383671
74165	NC_016617	TTGT	2	8	3022584	3022591	0 %	75 %	25 %	0 %	392383671
74166	NC_016617	CCGCG	2	10	3022596	3022605	0 %	0 %	40 %	60 %	392383671
74167	NC_016617	CG	3	6	3022981	3022986	0 %	0 %	50 %	50 %	392383672
74168	NC_016617	GAA	2	6	3023046	3023051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392383672
74169	NC_016617	TGG	2	6	3023054	3023059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383672
74170	NC_016617	CGCC	2	8	3023066	3023073	0 %	0 %	25 %	75 %	392383672
74171	NC_016617	GTC	2	6	3023151	3023156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383672
74172	NC_016617	TGGC	2	8	3023179	3023186	0 %	25 %	50 %	25 %	392383672
74173	NC_016617	TGG	2	6	3023213	3023218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383672
74174	NC_016617	CCT	2	6	3023231	3023236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383672
74175	NC_016617	CCA	2	6	3023249	3023254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383672
74176	NC_016617	CAG	2	6	3023316	3023321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383672
74177	NC_016617	GC	4	8	3023335	3023342	0 %	0 %	50 %	50 %	392383672
74178	NC_016617	CTC	2	6	3023343	3023348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383672
74179	NC_016617	CGGT	2	8	3023395	3023402	0 %	25 %	50 %	25 %	392383672

< Previous12...137138139140141142143144145146147148149Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.